Σύμφωνα με πηγές του υπουργείου Εθνικής Οικονομίας και Οικονομικών, η σχετική Οδηγία επιτρέπει την προαιρετική εφαρμογή μειωμένου ΦΠΑ σε ορισμένα προϊόντα, χωρίς υποχρέωση από τη χώρα. Αυτό αναφέρθηκε κατά τη διάρκεια συνέντευξης τύπου του πρωθυπουργού στη ΔΕΘ, αναφορικά με τη μη εναρμόνιση της ελληνικής κυβέρνησης με την Ευρωπαϊκή Οδηγία για τον ΦΠΑ σε τρόφιμα και φάρμακα, καθώς και την αύξηση του ορίου απαλλαγής ΦΠΑ για μικρές επιχειρήσεις. Αξίζει να σημειωθεί ότι η Κομισιόν αντέδρασε απειλώντας με αναφορά της Ελλάδας στο Ευρωπαϊκό Δικαστήριο.
Ωστόσο, σύμφωνα με τις ίδιες πηγές, "προφανώς δεν ισχύει" η προειδοποίηση της Κομισιόν, καθώς η φορολογική πολιτική εντός της Ευρωπαϊκής Ένωσης αποτελεί αρμοδιότητα των κρατών-μελών.
Τέλος, σημειώνεται ότι οι διατάξεις της Οδηγίας έχουν ενσωματωθεί στον Τελωνειακό Κώδικα που εγκρίθηκε τον Ιούλιο, με αποτέλεσμα η διαδικασία της προειδοποιητικής επιστολής από την Επιτροπή να μην συνεχιστεί. Επιπλέον, η Ελλάδα έχει ήδη μειωμένο ΦΠΑ σε πολλές περισσότερες κατηγορίες σε σχέση με τις περισσότερες ευρωπαϊκές χώρες.
