Οι δηλώσεις του πρωθυπουργού σχετικά με την ίδρυση υπουργείου Έρευνας και Ανάπτυξης προκάλεσαν έντονες αντιδράσεις από τον πρόεδρο της Νέας Αριστεράς, Αλέξη Χαρίτση, ο οποίος κατηγορεί τον πρωθυπουργό για την "διάλυση" του ενιαίου χώρου έρευνας.
Σύμφωνα με τον Χαρίτση, η μεταφορά της Γενικής Γραμματείας Έρευνας στο υπουργείο Ανάπτυξης οδήγησε στην υποβάθμιση του Ελληνικού Ιδρύματος Έρευνας και Καινοτομίας (ΕΛΙΔΕΚ) και στην παραβίαση ευρωπαϊκών κανόνων στην αξιολόγηση προγραμμάτων.
Επιπλέον, ο Χαρίτσης κατηγορεί την κυβέρνηση για τον κατακερματισμό των αρμοδιοτήτων και την υποχρηματοδότηση της έρευνας, ενώ αναφέρει τις αντιδράσεις του πρώην προέδρου του Εθνικού Συμβουλίου Έρευνας, Τεχνολογίας και Καινοτομίας, Σπύρου Αρταβάνη-Τσάκωνα, ο οποίος δήλωσε ότι "η έρευνα δεν είναι προτεραιότητα του πρωθυπουργού".
Τονίζοντας την αντίθεσή του, ο Χαρίτσης καταλήγει χαρακτηρίζοντας την πολιτική του κυβέρνησης ως "αριστεία στην κοροϊδία".